MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 plasmid pAS9A-2

Total Repeats: 2012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015561	CGG	2	6	78277	78282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917648
1502	NC_015561	CAC	2	6	78495	78500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917648
1503	NC_015561	TCG	2	6	78573	78578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917648
1504	NC_015561	GCG	2	6	78585	78590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917648
1505	NC_015561	ACG	2	6	78688	78693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917648
1506	NC_015561	CG	3	6	78703	78708	0 %	0 %	50 %	50 %	333917648
1507	NC_015561	GCTC	2	8	78820	78827	0 %	25 %	25 %	50 %	333917648
1508	NC_015561	AGC	2	6	78876	78881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917648
1509	NC_015561	CT	3	6	78911	78916	0 %	50 %	0 %	50 %	333917648
1510	NC_015561	GGT	2	6	79215	79220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917649
1511	NC_015561	CGCGGG	2	12	79259	79270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917649
1512	NC_015561	GAG	2	6	79287	79292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917649
1513	NC_015561	GTGCG	2	10	79316	79325	0 %	20 %	60 %	20 %	333917649
1514	NC_015561	CG	3	6	79324	79329	0 %	0 %	50 %	50 %	333917649
1515	NC_015561	CCGCGG	2	12	79346	79357	0 %	0 %	50 %	50 %	333917649
1516	NC_015561	GGCGC	2	10	79362	79371	0 %	0 %	60 %	40 %	333917649
1517	NC_015561	GCGGCC	2	12	79372	79383	0 %	0 %	50 %	50 %	333917649
1518	NC_015561	AGGT	2	8	79390	79397	25 %	25 %	50 %	0 %	333917649
1519	NC_015561	CGG	2	6	79439	79444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917649
1520	NC_015561	AGC	2	6	79447	79452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917649
1521	NC_015561	TGC	2	6	79471	79476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917649
1522	NC_015561	CCCG	2	8	79532	79539	0 %	0 %	25 %	75 %	333917649
1523	NC_015561	CGG	2	6	79580	79585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917649
1524	NC_015561	CGG	2	6	79598	79603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917649
1525	NC_015561	GTA	2	6	80099	80104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917650
1526	NC_015561	CACG	2	8	80128	80135	25 %	0 %	25 %	50 %	333917650
1527	NC_015561	CCG	2	6	80172	80177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917650
1528	NC_015561	AAC	2	6	80196	80201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917650
1529	NC_015561	GGC	2	6	80249	80254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917650
1530	NC_015561	CAA	2	6	80260	80265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917650
1531	NC_015561	GTG	2	6	80428	80433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917650
1532	NC_015561	CTG	2	6	80447	80452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917650
1533	NC_015561	TCT	2	6	80484	80489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917650
1534	NC_015561	TGC	2	6	80507	80512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917650
1535	NC_015561	GCC	2	6	80544	80549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917650
1536	NC_015561	GCT	2	6	80566	80571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917650
1537	NC_015561	AGA	2	6	80611	80616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917650
1538	NC_015561	GC	3	6	80641	80646	0 %	0 %	50 %	50 %	333917650
1539	NC_015561	GGT	2	6	80796	80801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917650
1540	NC_015561	GAG	2	6	80810	80815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917650
1541	NC_015561	CGC	2	6	80825	80830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917650
1542	NC_015561	GCG	2	6	80846	80851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917650
1543	NC_015561	GAA	2	6	80873	80878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917650
1544	NC_015561	GCG	2	6	80893	80898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917650
1545	NC_015561	TGGG	3	12	80961	80972	0 %	25 %	75 %	0 %	333917650
1546	NC_015561	GGCCTC	2	12	81137	81148	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333917650
1547	NC_015561	GT	3	6	81157	81162	0 %	50 %	50 %	0 %	333917650
1548	NC_015561	CGGG	2	8	81190	81197	0 %	0 %	75 %	25 %	333917650
1549	NC_015561	GCT	2	6	81218	81223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917650
1550	NC_015561	CAT	2	6	81259	81264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917650
1551	NC_015561	GAT	2	6	81287	81292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917650
1552	NC_015561	GGC	2	6	81317	81322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917650
1553	NC_015561	TCA	2	6	81366	81371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917650
1554	NC_015561	GCGG	2	8	81376	81383	0 %	0 %	75 %	25 %	333917650
1555	NC_015561	CGG	2	6	81385	81390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917650
1556	NC_015561	ACG	2	6	81429	81434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917650
1557	NC_015561	CGAT	2	8	81508	81515	25 %	25 %	25 %	25 %	333917651
1558	NC_015561	CT	3	6	81553	81558	0 %	50 %	0 %	50 %	333917651
1559	NC_015561	ACT	2	6	81560	81565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917651
1560	NC_015561	GC	3	6	81568	81573	0 %	0 %	50 %	50 %	333917651
1561	NC_015561	GT	3	6	81702	81707	0 %	50 %	50 %	0 %	333917651
1562	NC_015561	TTG	2	6	81718	81723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917651
1563	NC_015561	TCT	2	6	81777	81782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917651
1564	NC_015561	CAGTT	2	10	81794	81803	20 %	40 %	20 %	20 %	333917651
1565	NC_015561	TGC	2	6	81881	81886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917651
1566	NC_015561	GCT	2	6	81897	81902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917651
1567	NC_015561	GGGC	2	8	81909	81916	0 %	0 %	75 %	25 %	333917651
1568	NC_015561	AGC	2	6	81943	81948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917651
1569	NC_015561	CGT	2	6	82038	82043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917651
1570	NC_015561	GAA	2	6	82045	82050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917651
1571	NC_015561	CG	3	6	82092	82097	0 %	0 %	50 %	50 %	333917651
1572	NC_015561	GCC	2	6	82107	82112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917651
1573	NC_015561	GCG	2	6	82204	82209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917651
1574	NC_015561	TGC	2	6	82213	82218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917651
1575	NC_015561	CCG	2	6	82247	82252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917651
1576	NC_015561	GCA	2	6	82274	82279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917651
1577	NC_015561	GTC	2	6	82282	82287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917651
1578	NC_015561	GGT	2	6	82295	82300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917651
1579	NC_015561	CAG	2	6	82520	82525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917652
1580	NC_015561	CG	3	6	82583	82588	0 %	0 %	50 %	50 %	333917652
1581	NC_015561	TGC	2	6	82744	82749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917653
1582	NC_015561	GC	3	6	82758	82763	0 %	0 %	50 %	50 %	333917653
1583	NC_015561	GTT	2	6	82764	82769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917653
1584	NC_015561	TCT	2	6	82801	82806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917653
1585	NC_015561	CGG	2	6	82898	82903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917653
1586	NC_015561	GTA	2	6	82908	82913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917653
1587	NC_015561	CAG	2	6	82917	82922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917653
1588	NC_015561	GCG	2	6	83231	83236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917654
1589	NC_015561	GCC	2	6	83269	83274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917654
1590	NC_015561	CCA	2	6	83315	83320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917654
1591	NC_015561	CCG	2	6	83342	83347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917654
1592	NC_015561	CGC	2	6	83355	83360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917654
1593	NC_015561	CGG	2	6	83759	83764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917655
1594	NC_015561	TGC	2	6	83771	83776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917655
1595	NC_015561	TGT	2	6	83822	83827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917655
1596	NC_015561	TCG	2	6	83839	83844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917655
1597	NC_015561	GCCGAA	2	12	83908	83919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917655
1598	NC_015561	TCG	2	6	83935	83940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917655
1599	NC_015561	CA	3	6	83999	84004	50 %	0 %	0 %	50 %	333917655
1600	NC_015561	AAG	2	6	84127	84132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917655
1601	NC_015561	TCA	2	6	84143	84148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917655
1602	NC_015561	CAA	2	6	84156	84161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917655
1603	NC_015561	GCA	2	6	84171	84176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917655
1604	NC_015561	CCT	2	6	84198	84203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917655
1605	NC_015561	GCG	2	6	84260	84265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917655
1606	NC_015561	CGG	2	6	84399	84404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917655
1607	NC_015561	TGC	3	9	84476	84484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917655
1608	NC_015561	CAA	2	6	84510	84515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917655
1609	NC_015561	CGA	2	6	84516	84521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917655
1610	NC_015561	GCG	2	6	84554	84559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917655
1611	NC_015561	TCA	2	6	84581	84586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917655
1612	NC_015561	CCG	2	6	84592	84597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917655
1613	NC_015561	AAG	2	6	84673	84678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917655
1614	NC_015561	GTT	2	6	84759	84764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917655
1615	NC_015561	GGT	2	6	84769	84774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917655
1616	NC_015561	GCTT	2	8	84797	84804	0 %	50 %	25 %	25 %	333917655
1617	NC_015561	GAC	3	9	84805	84813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917655
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1620	NC_015561	GTT	2	6	84930	84935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917655
1621	NC_015561	CG	3	6	84967	84972	0 %	0 %	50 %	50 %	333917655
1622	NC_015561	CGA	2	6	85029	85034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917655
1623	NC_015561	GTC	2	6	85054	85059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917655
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1993	NC_015561	CGC	2	6	105541	105546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917676
1994	NC_015561	GAC	2	6	105548	105553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917676
1995	NC_015561	CGC	2	6	105569	105574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917676
1996	NC_015561	GCA	2	6	105635	105640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917676
1997	NC_015561	CGT	2	6	105680	105685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917676
1998	NC_015561	TTC	2	6	105691	105696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917676
1999	NC_015561	TC	3	6	105695	105700	0 %	50 %	0 %	50 %	333917676
2000	NC_015561	GCG	3	9	105702	105710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917676

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